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核仁是細胞核中突出的無膜凝聚物。它由數百種在核糖體RNA (rRNA)的快速轉錄和有效加工單位中具有不同作用的蛋白質組成,這些單位包括一個纖維中心和一個致密的纖維成分,以及顆粒成分中的核糖體組裝。
由于成像研究分辨率不足,大多數核仁蛋白的精確定位以及它們的特定定位是否有助于前rRNA加工的徑向通量仍然未知。因此,這些核仁蛋白如何與逐步的前rRNA加工進行功能協調需要進一步研究。
近日,有研究人員使用高分辨率活細胞顯微鏡篩選了200個候選核仁蛋白,并確定了12個蛋白富集于致密纖維成分(PDFC)的外圍。相關研究發表在《Nature》上,文章標題為:“Nucleolar URB1 ensures 3' ETS rRNA removal to prevent exosome surveillance"。
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在這些蛋白質中,不健康核糖體生物發生1 (URB1)是一種靜態的核仁蛋白,它確保了U8小核仁RNA識別的3'端pre-rRNA的錨定和折疊,并隨后在致密的纖原性成分- pdfc邊界處去除3'外部轉錄間隔(ETS)。
URB1缺失導致PDFC中斷、pre-rRNA運動不受控制、pre-rRNA構象改變和3' ETS保留。這些異常的3' ets附著的pre-rRNA中間產物激活外泌體依賴的核仁監視,導致28S rRNA產生減少,斑馬魚頭部畸形和小鼠胚胎發育延遲。這項研究提供了對功能性亞核仁組織的深入了解,并確定了rRNA成熟的生理必要步驟,該步驟需要相分離核仁中的靜態蛋白URB1。
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